Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tmf1B9EKI3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tmf1B9EKI3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tmf1B9EKI3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tmf1B9EKI3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.7 ms