Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CatipB9EKE5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CatipB9EKE5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CatipB9EKE5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms