Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp26c1B2RXA7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26c1B2RXA7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cyp26c1B2RXA7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms