Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Znf518aB2RRF6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Znf518aB2RRF6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Znf518aB2RRF6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Znf518aB2RRF6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Znf518aB2RRF6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Znf518aB2RRF6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Znf518aB2RRF6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Znf518aB2RRF6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Znf518aB2RRF6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms