Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Scn7aB1AYL1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Scn7aB1AYL1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Scn7aB1AYL1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms