Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap3aB1AWZ3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nipsnap3aB1AWZ3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap3aB1AWZ3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms