Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm16430A6X8J1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm16430A6X8J1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm16430A6X8J1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm16430A6X8J1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm16430A6X8J1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm16430A6X8J1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm16430A6X8J1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm16430A6X8J1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm16430A6X8J1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm16430A6X8J1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms