Protein–RNA interactions for Protein: A6NLE4

SMIM23, Small integral membrane protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM23A6NLE4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMIM23A6NLE4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SMIM23A6NLE4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms