Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Herc3A6H6S0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Herc3A6H6S0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Herc3A6H6S0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms