Protein–RNA interactions for Protein: A4D1E1

ZNF804B, Zinc finger protein 804B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF804BA4D1E1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZNF804BA4D1E1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZNF804BA4D1E1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ZNF804BA4D1E1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms