Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fibcd1A2AV25 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fibcd1A2AV25 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fibcd1A2AV25 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms