Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll9A2APC3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttll9A2APC3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttll9A2APC3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms