Protein–RNA interactions for Protein: A2A5E6

Znf385c, Zinc finger protein 385C, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf385cA2A5E6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Znf385cA2A5E6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Znf385cA2A5E6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms