Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
4933424G06RikA0A140LIP3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
4933424G06RikA0A140LIP3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms