Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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