Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Hdac5Q9Z2V6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Hdac5Q9Z2V6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Hdac5Q9Z2V6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Hdac5Q9Z2V6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms