Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y7

LYVE1, Lymphatic vessel endothelial hyaluronic acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYVE1Q9Y5Y7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LYVE1Q9Y5Y7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LYVE1Q9Y5Y7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms