Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LRP12Q9Y561 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
LRP12Q9Y561 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LRP12Q9Y561 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms