Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
TRAPPC8Q9Y2L5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
TRAPPC8Q9Y2L5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
TRAPPC8Q9Y2L5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms