Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PapolbQ9WVP6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PapolbQ9WVP6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PapolbQ9WVP6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.1 ms