Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nme3Q9WV85 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nme3Q9WV85 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nme3Q9WV85 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms