Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOX13Q9UN79 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX13Q9UN79 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX13Q9UN79 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms