Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gpc1Q9QZF2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpc1Q9QZF2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpc1Q9QZF2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms