Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irx4Q9QY61 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irx4Q9QY61 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irx4Q9QY61 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms