Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TVP23BQ9NYZ1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TVP23BQ9NYZ1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TVP23BQ9NYZ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms