Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZDHHC3Q9NYG2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZDHHC3Q9NYG2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms