Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF19Q9NS68 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TNFRSF19Q9NS68 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms