Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FBXO8Q9NRD0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXO8Q9NRD0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXO8Q9NRD0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms