Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IL1RAPQ9NPH3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IL1RAPQ9NPH3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IL1RAPQ9NPH3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms