Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SIX2Q9NPC8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SIX2Q9NPC8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms