Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Riox1Q9JJF3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Riox1Q9JJF3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riox1Q9JJF3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms