Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LratQ9JI60 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LratQ9JI60 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
LratQ9JI60 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LratQ9JI60 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LratQ9JI60 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms