Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PREBQ9HCU5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PREBQ9HCU5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms