Protein–RNA interactions for Protein: Q9H816

DCLRE1B, 5' exonuclease Apollo, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1BQ9H816 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLRE1BQ9H816 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCLRE1BQ9H816 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DCLRE1BQ9H816 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms