Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLSTN2Q9H4D0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLSTN2Q9H4D0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLSTN2Q9H4D0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CLSTN2Q9H4D0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms