Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
OtofQ9ESF1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
OtofQ9ESF1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
OtofQ9ESF1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OtofQ9ESF1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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