Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPW9

Tlr6, Toll-like receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr6Q9EPW9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tlr6Q9EPW9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tlr6Q9EPW9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tlr6Q9EPW9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tlr6Q9EPW9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms