Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Efhd1Q9D4J1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Efhd1Q9D4J1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Efhd1Q9D4J1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms