Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D7

Tmem30c, Cell cycle control protein 50C, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem30cQ9D4D7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Tmem30cQ9D4D7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmem30cQ9D4D7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmem30cQ9D4D7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms