Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx29Q9D3S3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx29Q9D3S3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx29Q9D3S3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms