Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2K6

D930007J09Rik, RIKEN cDNA D930007J09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D930007J09RikQ9D2K6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
D930007J09RikQ9D2K6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
D930007J09RikQ9D2K6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
D930007J09RikQ9D2K6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms