Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pramef12Q9D2F1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pramef12Q9D2F1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pramef12Q9D2F1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pramef12Q9D2F1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms