Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nde1Q9CZA6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Nde1Q9CZA6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nde1Q9CZA6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.8 ms