Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klhl35Q9CZ49 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Klhl35Q9CZ49 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Klhl35Q9CZ49 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms