Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nsfl1cQ9CZ44 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nsfl1cQ9CZ44 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nsfl1cQ9CZ44 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms