Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Exo5Q9CXP9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Exo5Q9CXP9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Exo5Q9CXP9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Exo5Q9CXP9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Exo5Q9CXP9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Exo5Q9CXP9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Exo5Q9CXP9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Exo5Q9CXP9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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