Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX34

Sugt1, Protein SGT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sugt1Q9CX34 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sugt1Q9CX34 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sugt1Q9CX34 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sugt1Q9CX34 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms