Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smc1aQ9CU62 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Smc1aQ9CU62 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms