Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem42Q9CR22 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem42Q9CR22 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms