Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CQC3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CQC3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CQC3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9CQC3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9CQC3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9CQC3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9CQC3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CQC3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CQC3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CQC3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CQC3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CQC3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q9CQC3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9CQC3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9CQC3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQC3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q9CQC3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms